Способ РАЗ
лучше осуществить импорт дампа из каталога, для чего в конфигурационный файл phpMyAdmin (config.inc.php) добавьте строку:
$cfg['UploadDir'] = './upload';
Способ ДВА
При импорте базы в PhpMyAdmin максимальный размер загружаемого файла по умолчанию равен 2М. Что бы изменить это значение нужно исправить upload_max_filesize в файле php.ini. Однако, этого может быть недостаточно. Если нужное значение больше заданного в переменной post_max_size в том же файле, если нужно можно поменять и его.
Ну и конечно же, нужно перезапустить apache.